W epoce baroku zaczęła kształtować się nowożytna nauka. Następował rozdział nauki od filozofii. To wówczas stworzono podstawy współczesnej chemii, która stopniowo oddzielała się od alchemii. Angielski uczony - Izaak Newton i francuski filozof - Kartezjusz propagowali dwa przeciwstawne kierunki filozoficzne. Newton był zwolennikiem empiryzmu, który zakładał poznanie świata za pomocą zmysłów. Z kolei Kartezjusz - racjonalizmu, zgodnie z którym poznanie rzeczywistości jest możliwe tylko poprzez rozum.