Kartezjusz poprzez swoje dociekania filozoficzne chciał zbudować podstawy wiedzy pewnej. Jego filozofia miała więc być fundamentem uniwersalnego i spójnego systemu wiedzy ludzkiej o wszystkich aspektach świata.

Swój projekt Kartezjusz obrazowo przyrównał do drzewa, którego korzeniami miała być metafizyka (ogólna teoria bytu), a pniem fizyka (wiedza o tym, co rozciągłe i przestrzenne). Z owego pnia miały wyrastać konary, którymi byłyby: medycyna, mechanika i etyka.

Kartezjański model wiedzy jako drzewa i jego poszczególnych części może uchodzić za