Brak wolności wyznania i nietolerancja religijna mogą skutkować:

• Represje i dyskryminacja wobec innowierców (np. holokaust Żydów przez III Rzeszę). 
• Wojen religijnych (np. w Niemczech czy Francji podczas reformacji).
• Masowych mordów na innowiercach (np. noc św. Bartłomieja).
• Ksenofobii i opóźnienia w rozwoju myślowym (np. Rzeczpospolita w pierwszej połowie XVIII w.).