Morze Bałtyckie powstało całkiem niedawno, bo około 10 000 lat temu, w wyniku erozyjnej działalności lądolodu skandynawskiego. Po jego wytopieniu powstało zagłębienie, które wypełniła woda. Stała się ona słona, ponieważ dochodzi do jej wymiany ze słonymi wodami Oceanu Atlantyckiego.

Charakterystyczne cechy środowiska przyrodniczego tego akwenu:

1. Niewielkie zasolenie, zmniejszające się dodatkowo w kierunku wschodnim i północnym;

2. Niewielka głębokość;

3. Słaba wymiana wody z Oceanem Atlantyckim;

4. Śródlądowe położenie;

5. Silne zanieczyszczenie;

6. Słabo urozmaicona linia brzegowa (niewiele wysp i półwyspów);

7. Niewielkie pływy morskie i falowanie;