Pewien tripeptyd zbudowany z aminokwasów białkowych ma masę molową 249 g·mol-1, a w jego cząsteczce znajdują się jedna grupa -SH oraz jedna reszta aminokwasu, którego cząsteczki są achiralne. Wiadomo też, że wolną grupę aminową ma reszta aminokwasu o najmniejszej masie cząsteczkowej, a reszta aminokwasu o największej masie cząsteczkowej ma wolną grupę karboksylową.
Napisz sekwencję opisanego tripeptydu za pomocą trzyliterowych kodów aminokwasów.
...........................................................................................................................................................................
Odpowiedź:
Sekwencja opisanego tripeptydu:
Gly-Ala-Cys
Wyjaśnienie:
Skoro mamy tripeptyd to oznacza, że występują w nim dwa wiązania peptydowe. Tworzenie każdego wiązania peptydowego uwalnia jedną cząsteczkę wody więc do masy molowej szukanego tripeptydu dodajemy masę molową dwóch cząsteczek wody i otrzymujemy sumę mas molowych trzech aminokwasów, które utworzyły ten tripeptyd:
Następnie analizujemy treść zadania, aby zidentyfikować aminokwasy:
- jedna grupa -SH w cząsteczce tego tripeptydu oznacza jedną resztę cysteiny.
- jedna reszta aminokwasu, którego cząsteczki są achiralne oznacza jedną resztę glicyny.
Znając masy molowe cysteiny (121 g/mol) oraz glicyny (75 g/mol) obliczymy masę molową trzeciego aminokwasu:
Taka masa molowa odpowiada masie molowej alaniny.
Wiemy więc, że tripeptyd zbudowany jest z cysteiny (Cys), glicyny (Gly) i alaniny (Ala), musimy jeszcze ustalić ich sekwencję:
- skoro aminokwas o najmniejszej masie cząsteczkowej tworzy N-koniec tego tripeptydu to pierwszym aminokwasem jest glicyna (ma najmniejszą masę molową)
- skoro aminokwas o największej masie cząsteczkowej tworzy C-koniec tego tripeptydu to ostatnim aminokwasem jest cysteina (ma największą masę molową)
- aminokwasem "środkowym" będzie więc alanina.
Dlatego sekwencja opisanego peptydu jest następująca: Gly-Ala-Cys
Katarzyna Kamińska
Nauczycielka chemii
Tutaj pojawi się lista Twoich książek
Zaloguj się i zacznij tworzyć ją już teraz.

