W warunkach dobrego oświetlenia eugleny, dzięki obecności chloroplastów, przeprowadzają fotosyntezę, w wyniku której wydzielają tlen. Ten tlen uzupełnia zużywany przez pantofelki i same eugleny w procesie oddychania, dlatego dodatkowe dotlenianie wody nie jest wtedy potrzebne. W ciemności eugleny, podobnie jak pantofelki, prowadzą oddychanie tlenowe, zużywając tlen rozpuszczony w wodzie. Natomiast eugleny nie mogą uzupełniać tlenu poprzez prowadzenie procesu fotosyntezy, gdy nie mają dostępu do światła, dlatego dotlenienie wody w ciemności jest konieczne.