Ekosystem jest to jednostka ekologiczna, w skład której wchodzą  biocenoza oraz biotop. Biocenoza obejmuje wszystkie populacje żyjące na danym obszarze, które są powiązane ze sobą zależnościami, z kolei biotopem określa się środowisko nieożywione, w którym funkcjonuje biocenoza. Biotop i biocenoza powiązane są ze sobą procesami przepływu energii i obiegu materii w ekosystemie. Przykładowo osobniki należące do populacji kozicy tatrzańskiej (biocenoza) żyjącej w Tatrach zasiedlają zbocza skalne i korzystają z wody znajdującej się na tym terenie.