Na schemacie przedstawiono fragment cząsteczki białka o strukturze III-rzędowej oraz warunkujące tę strukturę różne oddziaływania występujące pomiędzy łańcuchami bocznymi aminokwasów: wiązania chemiczne oparte na przyciąganiu elektrostatycznym (1), wiązania kowalencyjne (2), interakcje hydrofobowe (3) i oddziaływania jonowe (4).

 

1.1. Podaj nazwy wiązań chemicznych stabilizujących III-rzędową strukturę białka, oznaczonych na schemacie numerami 1. i 2.

1. ...    2. ...

 

1.2. Na przykładzie enzymów białkowych wyjaśnij, w jaki sposób struktura przestrzenna białka warunkuje jego funkcję katalityczną. W odpowiedzi uwzględnij mechanizm działania enzymów. 

---

 

Rozwiązanie:

1.1.

1. wodorowe

2. disiarczkowe

 

1.2. Dzięki odpowiedniej strukturze przestrzennej enzymu, a dokładniej centrum aktywnego, możliwe jest utworzenie kompleksu E-S, który warunkuje powstanie konkretnego substratu.

---

 

Wskazówka:

Mechanizm działania enzymów

Każdy enzym posiada w swojej cząsteczce centrum aktywne, które zbudowane jest z  konkretnej sekwencji aminokwasów. Enzymy tworzą z substratem (lub substratami) nietrwały kompleks enzym-substrat (E-S). Z tym, że centrum aktywne enzymu dopasowuje się do konkretnego substratu. Utworzony kompleks E-S następnie rozpada się z utworzeniem produktu (lub produktów), a enzym biorący udział w reakcji nie ulega trwałej przemianie chemicznej, ani nie ulega zużyciu.