Znaczenie bakterii może być zarówno pozytywne i negatywne.

Dzięki swojej działalności przygotowują one środowisko bytowania dla innych organizmów, ponieważ są organizmami pionierskimi pojawiają się w miejscach, gdzie nie funkcjonuje jeszcze życie. Są saprobiontami - rozkładają martwą materię organiczną do prostych związków nieorganicznych, które mogą zostać wykorzystane przez inne organizmy np. przez rośliny. Dzięki swojej działalności użyźniają glebę. W życiu człowieka są