Owocniki niektórych grzybów są smacznym pożywieniem dla ludzi, ale żywią się nimi także zwierzęta. Poza tym, związki nieorganiczne, które powstają z rozkładanych przez grzyby szczątków roślin i zwierząt są wykorzystywane przez rośliny. Wzbogacają także glebę w związki mineralne i tym sposobem użyźniają ją, a na takich glebach lepiej rosną rośliny, także te hodowane i uprawiane przez człowieka. Grzyby, oprócz bezpośredniego spożycia owocników, wykorzystywane są w przemyśle spożywczym w inny sposób. Dobrze wszystkim znane drożdże, w zależności od gatunku stosowane są w przemyśle spożywczym do wytwarzanie chleba, piwa czy wina. W procesie produkcji wykorzystywany jest proces fermentacji, czyli oddychania beztlenowego. Inne grzyby - tzw. pleśnie stosuje się do produkcji serów o charakterystycznym smaku i zapachu, a także pozyskuje się z nich antybiotyki. Najbardziej znanym antybiotykiem jest penicylina wytwarzana przez grzyby pleśniowe z rodzaju Penicilinum.