Zasolenie Morza Bałtyckiego jest mniejsze niż Morza Północnego, ponieważ Morze Północne ma zdecydowanie lepszą wymianę wód z Oceanem Atlantyckim (które ma większe zasolenie). Do Morza Północnego ponadto uchodzi zdecydowanie mniej rzek niż do Morza Bałtyckiego. Morze Bałtyckie jest ponadto płytsze od Morza Północnego, dlatego też dopływ wód rzecznych zdecydowanie szybciej obniża w nim zasolenie.