Różnica polega na innej hybrydyzacji atomu centralnego tworzącego te cząsteczki. Atom tlenu w cząsteczce wody oraz atom azotu w cząsteczce amoniaku posiadają hybrydyzację sp³, natomiast atom berylu - sp, a atom boru - sp². Atom berylu i atom wodoru nie posiadają wolnych par elektronowych, a wszystkie ich elektrony walencyjne biorą udział w tworzeniu wiązań. Przez to moment dipolowy cząsteczek jest równy zero. Dla cząsteczki wody i amoniaku atom centralny posiada wolne pary elektronowe, co powoduje, że moment dipolowy cząsteczki nie jest równy zero.