Układ odpornościowy człowieka ma trudności ze zwalczaniem świdrowca gambijskiego ze względu na wytwarzanie innego wariantu antygenu białek VSG przez każde kolejne pokolenie świdrowca. Następne warianty w kolejnych pokoleniach posiadają antygeny o odmiennej budowie molekularnej. Sprawia to trudność przy odpowiedzi immunologicznej - komórki pamięci wytwarzają przeciwciała zwalczające poprzedni wariant białek VSG.