Należy zastosować III. metodę, w której wykorzystuje się jedną z technik inżynierii genetycznej - technikę PCR, ponieważ umożliwia ona powielenie materiału genetycznego wirusa wykorzystując jako matrycę nawet śladowe ilości DNA, co umożliwia skuteczne odczytanie sekwencji i określenie typu wirusa z dużą dokładnością.