Białko FcRn transportuje w selektywny sposób przeciwciała IgG - niskie pH treści dwunastnicy utrudnia wiązanie przeciwciał IgA. Przeciwciała IgG związane z białkiem transportowym są chronione przed strawieniem, podczas transportu przez enterocyt, dzięki czemu trafiają do naczyń krwionośnych. Pojedyncze przeciwciała IgA są w stanie przenikać do wnętrza enterocytów przy okazji transportu przeciwciał IgG, jednak bez towarzystwa białka FcRn ulegają strawieniu w lizosomach.