Różnice w funkcjonowaniu układów somatycznego i autonomicznego:

• układ autonomiczny odbiera bodźce z wnętrza organizmu, a układ somatyczny ze środowiska zewnętrznego;
• układ autonomiczny działa niezależnie od naszej woli, z kolei działanie układu somatycznego jest związane z wykonywaniem świadomych ruchów;
• układ autonomiczny reguluje pracą serca, mięśni gładkich i gruczołów, zaś układ somatyczny  - mięśni szkieletowych.