Podwzgórze odpowiedzialne jest za przyjmowanie, przetwarzanie i reagowanie na wszystkie zmiany zachodzące wewnątrz organizmu jak i w środowisku zewnętrznym. W zależności od docierającego sygnału może steruje ono zarówno pracą układu nerwowego jak i hormonalnego. Wpływ podwzgórza na układ nerwowy polega na wysyłaniu impulsów  nerwowych, które koordynują funkcjonowanie ośrodków w korze mózgu, pniu mózgu i rdzeniu kręgowym, a także regulują pracę autonomicznego układu nerwowego. Wpływ na układ hormonalny polega zaś na wydzielaniu hormonów sterujących pracą przysadki. Podwzgórze wydziela hormony, które w zależności od potrzeb pobudzają lub hamują pracę przysadki i wydzielanie przez nią hormonów, także hormonów tropowych.