Podobieństwa:

• system odpornościowy organizmu, któremu podano szczepionkę, uczy się rozpoznawać i zwalczać drobnoustroje chorobotwórcze;

Różnice:

• w szczepionkach tradycyjnych podawane są żywe drobnoustroje zaś w szczepionkach DNA jedynie plazmidy zawierające geny kodujące białka antygenów;
• szczepionki DNA są szybsze w przygotowaniu;
• szczepionki DNA można przechowywać w temperaturze pokojowej, a tradycyjne muszą być chłodzone;