Paprotniki są roślinami żyjącymi głównie na lądzie, w środowisku wilgotnym, ale niektóre gatunki zasiedlają zbiorniki wodne. Paprotniki są szeroko rozprzestrzenione w lasach równikowych, ze względu na dużą wilgotność oraz w lasach klimatu umiarkowanego.

Przykłady miejsc, w których można spotkać przedstawicieli tej grupy to:

- las

- łąka

- ogród

- mieszkanie, balkon (jako roślina doniczkowa)